■環境設定→どっか忘れたが拡張子設定を
html→phpに変更

■各テンプレートの一行目の宣言部を変更

<? echo('<?xml version="1.0" encoding="<$MTPublishCharset$>"?>') ?>

■mt-config.cgiに以下追加
※さくらインターネット鯖の場合）

HTMLUmask 0022
DirUmask 0022
HTMLPerms 0777

その他メモ
HTMLソースを投稿するとエライこっちゃになるんで
そのまま表示してくれるプラグイン↓を追加

【EntityRefButton】

とても便利。